Junto con el cuidado medioambiental, la plena Seguridad en los Túneles de Artxanda es el objetivo fundamental perseguido en su construcción y puesta en servicio.

Los Túneles cuentan con un proyecto específico para sus instalaciones, aprobado por la Diputación Foral de Bizkaia, que contempla lo referente a información, comunicación, vigilancia, seguridad y control . Todos los sistemas son gestionados desde el Centro de Control situado en el edificio singular del área de peaje.

El proyecto EuroTAP ha evaluado 49 túneles de 14 países europeos, entre ellos 8 en España y ha otorgado a los Túneles de Artxanda la máxima calificación en materia de Seguridad.